Bhattacharya Lab Home
Please Enter your (one) query sequence in FASTA format below:
Please choose from the following BLAST options:
Select BLAST- program: Expect:  
 
(option produces one output file with information on all the checked genomes)

(this option will produce separate output files for each checked genome)
Chromalveolata
     
  Alveolata
    Dinoflagellates
      Alexandrium tamarense.fasta
          Amphidinium.fasta
          Heterocapsa triquetra.fasta
          Karenia brevis.fasta
          Karlodinium micrum.fasta
          Lingulodinium.fasta
          Oxyrrhis marina
          Oxyrrhis marina
      Apicomplexa
          Plasmodium falciparum.fasta
          Cryptosporidium homins
    Ciliates
          Paramecium tetraurelia
          Tetrahymena thermophila.fasta
  Chromista
    Cryptophyta
          Goniomonas pacifica
          Guillardia theta
          Guillardia theta
          Guillardia theta (nucleomorph) (upcoming)
          Rhodomonas salina
    Haptophyta
          Emiliania-2005.fas
          Isochrysis galbana CCMP 1323 clusters
          Pavlova lutheri clusters
    Stramenopiles
          Blastocystis hominis
        Diatoms
          Phaeodactylum tricornutum.fasta
          Thalassiosira pseudonana.fasta
        Oomycetes
          Phytophthora ramorum.fasta
          Phytophthora sojae.fasta
   
Plantae
     
  Reds
          Cyanidischyzon merolae.fasta
          Galdieria sulphurariaCDS.fasta
          Chondrus crispus
          Porphyra yezoensis
  Glaucophytes
          Glaucocystis nostochinearum_PEP
          Cyanophora paradoxa1PEP
          Cyanophora paradoxa2PEP
          Cyanophora paradoxaCLUSTERS
          Cyanophora paradoxaUNIQUES
  Greens
          Chlamydomonas.fasta
          Osterococcus lucimarinus.fasta
          Ostreococcus tauri.fasta
          Mesostigma viride.fasta
          Scenedesmus obliquus clusters
          Helicosporidium sp.fasta
          Physcomitrella patens
   
Excavates
             
          Euglena gracilis PEP 11 2006
          Giardia lamblia SOGIN 11 2006
          Jakoba bahamensis PEP 11 2006
          Jakoba libera PEP 11 2006
          Malawimonas californiana PEP 11 2006
          Malawimonas jakobiformis PEP 11 2006
          Reclinomonas Americana PEP 11 2006
          Trichomonas vaginalis NCBI 11 2006 (upcoming)
   
Rhizaria
             
          Bigelowiella natans PEP 11 2006
          Reticulomyxa filosa NCBI 11 2006
          Foraminifers NCBI 11 2006 (all forams at NCBI November 2006)
   
Amoebozoa
             
          Acanthamoeba_castellanii_PEP_2006
          Dictyostelium _discoideum_NCBI_2006
          Entamoeba_hystolitica_NCBI_11_2006
          Hartmannella_vermiformis
          Mastigamoeba_balamuthi_PEP_2006